Vùng Coquimbo tạo thành phần hẹp nhất, hay còn gọi là 'eo' của Chile, và do đó là một trong những vùng có nhiều núi non của đất nước, vì dãy Andes chạy gần biển hơn những nơi khác. Khu vực này có các loài sinh vật biển đáng chú ý cũng như các loài có liên quan đến các vùng núi. Đối với các sinh vật biển, các khu vực nước trồi khuyến khích năng suất sinh học ngoài khơi khu vực bờ biển Thái Bình Dương của Chile.[3]

Ở các khu vực miền núi phía nam của Vùng Coquimbo, tìm thấy loài cọ vang Chile quý hiếm và có nguy cơ tuyệt chủng, môi trường sống của chúng bị đe dọa bởi dân số gia tăng trong khu vực và nạn phá rừng liên quan để mở rộng dân cư và nông nghiệp. [4]

Thung lũng Elqui là nơi có một số đài quan sát thiên văn,[5] do bầu trời quang đãng của khu vực. Đây cũng là nơi có con đập Puclaro dài 640 mét, ngăn sông Elqui và tạo ra một hồ chứa 4.630.000 m³ nước để tưới tiêu nông nghiệp.